Menjadi Bank Isolat Patogen rujukan di tingkat nasional dan regional berazaskan pemanfaatan secara optimal plasma nutfah untuk kesejahteraan umat manusia. Adanya bank isolat ini diharapkan dapat memfasilitasi dan mempermudah para peneliti untuk melakukan berbgai penelitian seperti misalnya dalam mempelajari evolusi karakter mikroba secara berkesinambungan. Adanya fasilitas ini memungkinkan untuk melakukan rekam data mikroba setiap saat diinginkan. Di samping itu, adanya bank isolat dapat melestarikan plasma nutfah yang ada di Indonesia serta mempermudah pengguna kepentingan (stake holder) untuk mengakses mikroba yang dibutuhkannya untuk tujuan pengembanagn ilmu dan teknologi maupun untuk tujuan komersial misalnya dalam pengembangan vaksin, kit diagnostic dan obat-obatan. Pada langkah awal, bank isolat ini masih memberikan prioritas pada mikroba patogen sampai bank isolat ini mampu secara fisik menampung seluruh isolat mikroba baik yang patogen maupun nonpatogen. Isolat yang ada di bank isolat FKH IPB dapat diakses oleh siapa saja dengan memenuhi syarat dan ketentuan yang berlaku. Setiap orang atau institusi dapat pula menitipkan kekayaan isolatnya kepada bank isolat ini sesuai ketentuan yang berlaku, mengikuti azas kesetaraan, transparansi dan keadilan.