(1) Isolat A/duck/Nagrakl/IPB26/2006/H5N1
Virus Avian Influenza  A/duck/Nagrakl/IPB26/2006/H5N1 dari itik sehat, yang dipelihara di halamam rumah bersama-sama dengan ayam kampung di daerah Nagrak Sukabumi pada tahun 2005. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji Hemagglutination Inhibition Test (HI) menggunakan serum spesifik terhadap H5. Uji PCR menggunakan primer WHO tidak berhasil mendeteksi material genetik H5 dan N1 untuk isolat ini.

(2) Isolat A/quail/Sleman/IPB1/2004 (H5N1)
Virus Avian Influenza  A/quail/Sleman/IPB1/2004/H5N1 dari puyuh yang mati dengan gejala spesifik terserang AI di Sleman pada tahun 2004.

(3) Isolat A/cat/Parung/IPB1/2007 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/cat/Parung/IPB1/2007 (H5N1) dari kucing sehat, yang dipelihara di lingkungan peternakan ayam di daerah Parung pada tahun 2005. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji Hemagglutination Inhibition Test (HI) menggunakan serum spesifik terhadap H5. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil mendeteksi material genetik H5.

(4) Isolat A/cat/Parung/IPB2/2007 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/cat/Parung/IPB2/2007 (H5N1) dari kucing sehat, yang dipelihara di lingkungan perumahan pada tahun 2007. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil mendeteksi material genetik H5.

(5) Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB1/2007 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB1/2007 (H5N1) dari ayam kampung mati dengan gejala infeksi AI di Cikole Bandung tahun 2007. Virus ini belum diidentifikasi dan dikarakterisasi lebih lanjut.

(6) Isolat A/kampong chicken/Tasikmalaya/IPB 60/2005 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB1/2007 (H5N1) dari ayam kampung mati dengan gejala infeksi AI di Tasikmalaya tahun 2005. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji Hemagglutination Inhibition Test (HI) menggunakan serum spesifik terhadap H5. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil dideteksi material genetik H5 dan N1.

(7) Isolat A/kampong chicken/Bogor/IPB1/2004 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/kampong chicken/Bogor/IPB1/2004 (H5N1) dari ayam kampung mati dengan gejala infeksi AI di Bogor tahun 2004. Virus ini belum diidentifikasi dan dikarakterisasi lebih lanjut.

(8) Isolat A/duck/NTB/IPB1/2004 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/duck/NTB/IPB1/2004 (H5N1) dari itik yang mati dengan gejala infeksi AI Mataram tahun 2004. Virus ini belum diidentifikasi dan dikarakterisasi lebih lanjut.

(10) Isolat A/pig/Denpasar/UNUD1/2004 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat  A/pig/Denpasar/UNUD1/2004 (H5N1) dari babi yang mati dengan gejala gangguan pernapasan di Denpasar tahun 2004. Virus ini belum diidentifikasi dan dikarakterisasi lebih lanjut.

(11) Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB3/2007 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB3/2007 (H5N1) dari ayam kampung mati dengan gejala infeksi AI di Cikole tahun 2007. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji Hemagglutination Inhibition Test (HI) menggunakan serum spesifik terhadap H5. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil dideteksi material genetik H5 dan N1.

(12) Isolat A/cat/Bogor/IPB1/2007 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/cat/Bogor/IPB1/2007 (H5N1) dari kucing sehat, yang dipelihara di lingkungan pasar tradisional Bogor pada tahun 2007. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil mendeteksi material genetik N1 namun tidak H5.

(13) Isolat A/kampong chicken/Tasikmalaya/IPB1/2005  (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/kampong chicken/Tasikmalaya/IPB1/2005  (H5N1) dari ayam kampung mati dengan gejala infeksi AI di Cikole tahun 2005. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji Hemagglutination Inhibition Test (HI) menggunakan serum spesifik terhadap H5. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil dideteksi material genetik H5 dan N1.

(14) Isolat A/chicken/Bogor/IPB1/2004 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/chicken/Bogor/IPB1/2004 (H5N1) dari ayam ras petelur sehat di daerah Bogor tahun 2004. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji Hemagglutination Inhibition Test (HI) menggunakan serum spesifik terhadap H5. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil dideteksi material genetik H5 dan N1.

(15) Isolat A/chicken/Tanggerang/IPB1/2003 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/chicken/Tanggerang/IPB1/2004 (H5N1) dari ayam ras petelur yang mati dengan gejala AI di daerah Tanggerang tahun 2003. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji Hemagglutination Inhibition Test (HI) menggunakan serum spesifik terhadap H5. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil dideteksi material genetik H5 dan N1.

(16) Isolat A/pig/Denpasar/UNUD1/2004 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/pig/Denpasar/IPB1/2004 (H5N1) dari babi yang menderita gangguan pernapasan. Isolat ini belum dikarakterisasi lebih lanjut.

(17) Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB4/2006(H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB4/2006(H5N1) diisolasi dari ayam kampung di daerah Cikole Bandung pada tahun 2006. Isolat ini belum dikarakterisasi lebih lanjut.

(18) Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB8/2007 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB8/2007 (H5N1) diisolasi dari ayam kampung di daerah Cikole Bandung pada tahun 2007. Isolat ini belum dikarakterisasi lebih lanjut.

(19) Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB9/2007 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/kampong chicken/Cikole/IPB9/2007 (H5N1) diisolasi dari ayam kampung di daerah Cikole Bandung pada tahun 2007. Isolat ini belum dikarakterisasi lebih lanjut.

(20) Isolat A/cat/Bogor/IPB1/2007 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/cat/Bogor/IPB1/2007 (H5N1) diisolasi dari kucing sehat di daerah Bogor tahn 2007. Isolat virus AI ini mengaglutinasi sel darah merah dan pada uji HI mampu diinhibisi dengan antibodi spesifik terhadap H5. Uji PCR dengan primer WHO mampu mengamplifikasi template N1.

(21) Isolat A/chicken/Legok/IPB2/2004 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/chicken/Legok/IPB2/2004 (H5N1) dari ayam ras mati dengan gejala infeksi AI di wilayah Tanggerang tahun 2004. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji Hemagglutination Inhibition Test (HI) menggunakan serum spesifik terhadap H5. Uji PCR menggunakan primer WHO berhasil dideteksi material genetik N1.

(22) Isolat A/duck/Nagrakl/IPB29/2005 (H5N1)
Virus Avian Influenza Isolat A/duck/Nagrakl/IPB29/2005 (H5N1) dari itik sehat daerah Nagrak tahun 2005. Virus ini mampu mengaglutinasi sel darah merah pada uji hemaglutination test (HA test) dan telah diidentifikasi sebagai virus AI H5N1 berdasarkan uji PCR menggunakan primer WHO berhasil dideteksi material genetik H5 dan N1.

(23) Isolat ND/chicken/Jonggol/IPB1/2003 (vvND)
Virus ND isolat ND/chicken/Jonggol/IPB1/2003 diisolasi dari ayam yang secara klinis dan patologis terinfeksi ND. Isolat ini bersifat sangat virulen (very virulent ND), bersifat velogenic viscerotropic. Isolat telah diuji dengan  HI menggunakan serum spesifik terhadap ND

(24) Isolat ND LaSota
Virus ND isolat ND/Lasota bersifat mild dan digunakan sebagai seed vaccine.

(25) Isolat IBD/chicken/Bogor/IPB1/1999
Virus IBD bersifat ganas, diisolasi dari ayam petelur, wilayah isolasi tidak diketahui. Isolat ini belum dikarakterisasi lebih lanjut.

(26) Isolat BA/cattle/Bogor/IPB1/2008
Isolat bakteri Brucella abortus ini diisolasi dari sapi perah dari daerah Bogor pada tahun 2008. Isolat ini telah dikarakterisasi berdasarkan morfologi dan reaksi biokimiawi.

(27) Isolat EC/unknown/Bogor/IPB2/2008
Isolat bakteri Escherichia coli ini telah dikarakterisasi berdasarkan morfologi dan reaksi biokimiawi.

(28) Isolat S/cattle/unknown/IPB3/2008
Isolat bakteri Salmonella sp. Diisolasi dari sapi dan telah diidentifikasi secara morfologik dan biokimiawi.

(29) Isolat Ssp/unknown/Bogor/IPB4/2008
Isolat bakteri Staphylococcus sp. diisolasi dari sapi dan telah diidentifikasi secara morfologik dan biokimiawi.

(30) Isolat Strsp/cattle/Bogor/IPB5/2008
Isolat bakteri Streptococcus sp. diisolasi dari sapi dan telah diidentifikasi secara morfologik dan biokimiawi.

(31) Isolat Cl/?/Bogor/IPB6/2008
Isolat bakteri Clostridium sp. diisolasi telah diidentifikasi secara morfologik dan biokimiawi.

(32) Isolat Bant./soil/Bogor/2006
Isolat bakteri Bacillus anthracis diisolasi dari tanah di daerah Bogor dan telah diidentifikasi secara morfologik dan biokimiawi.